1958年，为了适应煤炭运输方便，由原中华人民共和国铁道部第四设计院勘察设计了原长牛铁路，长兴站为原长牛铁路的重要中间站。

1959年3月，原长牛铁路正式动工修建。

1960年底，伴随着原长牛铁路正式通车，车站开通运营，时称长兴站，当时的车站的面积仅有五六十平米，既当售票处又做候车室。

2012年6月20日，车站更名为长兴南站。

2020年6月20日起，长兴南站实施电子客票。

截至2012年9月，长兴南站占地面积7万平方米，站房为一层平面结构。长兴南站

长兴南站内外景(4张)

截至2014年1月，长兴南站站房设有售票厅、候车大厅、检票口和进、出站口。其中，售票厅共设5个窗口，白天开放3至5个窗口，夜间开放2至3个窗口（24小时），每个窗口均可以购买预售票、当日票以及退票、改签、取票； 候车大厅设置有6台五匹功能的空调。

截至2012年9月，长兴南站站场规模为2台6线，途经线路为宣杭铁路和新长铁路。

截至2016年2月，长兴南站设有2台自动售票机，位于车站的售票厅内。

客户中心

长兴南站设有学雷锋志愿服务站，为旅客提供信息咨询、秩序维护、旅客引导、解答问讯、扶老助残等服务。

公安制证

截至2014年1月，长兴南站设有公安制证处，位于车站售票厅右侧的车站派出所内，提供办理临时身份证明的服务。

2012年，长兴南站年客运量为101.1万人次。

截至2016年1月，长兴南站日旅客发送量在3000人次左右，铁路春运期间发送量在四五千人次左右。

2017铁路春运期间，长兴南站完成客运量14.8万人次，其中发送旅客7.2万人次，到达7.6万人次。

公交线路

截至2018年9月，长兴南站设有火车南站公交枢纽，于2017年4月1日起正式投入使用，途经线路共有5条。

长兴南站作为一座桥梁，拉近着长兴与外面世界的联系。在鸣笛声中，火车为长兴带来了财富、机遇和改变，为长兴的发展源源不断地注入生机，促进了长兴经济与社会的发展。（长兴新闻网 评）